Michal Habaj autorom vedeckýchmonografiíDruhá moderna(2005) aModel človeka asveta vbásnickom diele Jána Smreka(2013),DZܲܳٴǰdzSlovníka diel slovenskej literatúry 20. storočia(2006) aSlovníka diel slovenskej literatúry 19. storočia(2014). Vydal básnické zbierky80-967760-4-5(1997),Gymnazistky. Prázdniny trinásťročnej(1999),Korene neba. Básne zposledného storočia(2000),Básne pre mŕtve dievčatá(2004) aMichal Habaj(2012). Pod pseudonymom Anna Snegina vydal zbierky poéziePas de deux(2003) aBásne zpozostalosti(2009). Jeho básne sú súčasťou knihy fotografií Doroty SadovskejEmergency Entrance / Núdzový vchod(2009). Je jedným zo spoluautorov experimentálneho básnického projektuGenerator X: Hmlovina(1999) aGenerator X_2: Nové kódexy(2013). Ako spoluautor sa zúčastnil na medzinárodnom projekteThe European Constitution in Verse(Brusel, 2009). Jeho poézia bola zaradená do mnohých antológií a výberov. Habajove básnické zbierky programovo narúšajú tradičné chápanie autorského a lyrického subjektu.Jedným z básnikových cieľov sa okrem zážitkovosti stáva dekonštrukcia ustálených spôsobov písania poézie a rekonštrukcia poézie postavenej na novej platforme palimpsestu tradičných a post moderných prvkov.